由于自動化立體庫多方面的優越性，特別適合于醫藥行業藥品及原材料的儲存。因此，在過去10年來，越來越多的醫藥企業傾向于采用自動化立體庫解決藥品的庫存問題。
其次是GMP和GSP的認證，對藥品的儲存環境，尤其是對自動化立體庫應用提出專門要求。客觀上推動了自動化立體庫在醫藥行業中的應用。
自動化立體庫的必要性和適應性主要還應從安全性、成本、效率等幾個方面考慮。
安全性方面，自動化立體庫采用托盤單元式存儲方式，作業采用自動化作業方式，充分滿足藥品儲存過程中對于溫度監控，批號管理，效期管理，先入先出的要求。采用自動化作業模式，不僅對托盤碼垛提出了更高要求，而且還大大減少人工堆垛作業帶來的風險。藥品儲存的安全性得以保障。
建設成本方面，立體庫儲存能力大致是平置儲存的6-10 倍（滿足同樣條件，不考慮作業區和柱網影響），是叉車庫的2 -3倍。以此進行計算，立體庫的當量投入成本遠低于多層樓庫和叉車庫。越是大型的倉庫，立體庫的優勢越明顯。
運營成本方面，自動化立體庫也有明顯的優勢。以標準5 巷道立體庫作為測算基礎，立體庫設備的運營成本僅為多層樓庫的80%左右。同樣，規模越大的系統，立體庫的優勢越大。
應該說明的是，成本問題與土地、人工工資、管理水平有比較大的關系。此外，中國與國外也有比較大的差異。在國外廣泛采用的VNA 技術，在中國的優勢并不明顯。其根本原因是國外的VNA窄巷道叉車價格遠低于國內進口價（約為70% 左右），而國內 的堆垛 機價格 僅為歐洲進口的25-30%，所以采用自動化立體庫在中國更加具有成本優勢。
采用自動化立體庫作業可大幅度提升作業效率，這一點已經得到企業的充分認可。從未來人力成本逐漸上升的基本趨勢看，盡可能多的采用自動化作業替代人工作業將是提高效率和降成本的有效手段。國外如此，中國也如此。
以國藥上海公司為例，2004 年開始建設新物流系統，采用5 個巷道的自動化立體庫，存儲能力提升6倍以上，多年使用的效果表明，貨物的損耗率從以前的約3/1000 降低到萬分之一以下，配送能力從原來的約50 億提升到2012 年的150 億以上，人均效率提高60%，配送成本也得到了有效控制。
當然，我們也應該理性地看到，自動化立體庫的應用并非萬能。其適應性應建立在較大庫存和較高作業效率的基礎之上。如果企業的經營規模還很小，采用自動化立體庫是應慎重的。以醫藥流通行業為例，如果年配送能力小于10億元，一般不建議采用自動化立體庫系統。新版GSP系統要求自動化立體庫不少于5 個巷道，貨位數不少于2000 托盤，其背后的意愿一方面是提高市場準入門檻，降低管理成本，另一方面也是為了提高作業效率，降低物流成本。
發展趨勢
對于醫藥行業來說，自動化立體庫的應用已經處于全面開花階段。有多方面的原因推動這一技術的發展。
首先是隨著企業集約化發展，對自動化物流的自身需求已經日益迫切。我國醫藥流通行業的基本架構已經初具雛形，以國藥、上藥、華潤為代表的大型企業，已經基本趨向于達到或基本達到年銷售1000億的目標，而以九州通等為代表的中型企業，已經完成或正在沖擊100 億的目標。這種集約化的發展模式，對以自動化立體庫為代表的現代物流產生巨大需求。
其次是政策導向。2013 年6 月1 日，新版GSP將正式執行，這將在政策層面推動自動化立體庫在醫藥物流中的更為廣泛的應用。
技術發展方面，更高水平和更多形式的自動化立體庫將成為今后發展的重點。除普通的托盤式立體庫外，以箱為儲存單元的mini-Load 立體庫在揀選系統中將發運行正常，發揮了重要作用。而基于“貨到人”揀選的立體庫系統其形式將更加多樣化，如多層小車立體庫，旋轉貨架型立體庫等將是今后應用的重要組成部分。